Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Egr1P08046 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Egr1P08046 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Egr1P08046 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Egr1P08046 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Egr1P08046 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Egr1P08046 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Egr1P08046 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Egr1P08046 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Egr1P08046 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Egr1P08046 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Egr1P08046 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Egr1P08046 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms