Protein–RNA interactions for Protein: P06880

Gh1, Somatotropin, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gh1P06880 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gh1P06880 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gh1P06880 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gh1P06880 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gh1P06880 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gh1P06880 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gh1P06880 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gh1P06880 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms