Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TnfP06804 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TnfP06804 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TnfP06804 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TnfP06804 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TnfP06804 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TnfP06804 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TnfP06804 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TnfP06804 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TnfP06804 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnfP06804 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnfP06804 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnfP06804 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnfP06804 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnfP06804 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnfP06804 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnfP06804 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnfP06804 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnfP06804 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnfP06804 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnfP06804 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnfP06804 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnfP06804 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnfP06804 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnfP06804 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnfP06804 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnfP06804 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnfP06804 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnfP06804 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnfP06804 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnfP06804 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnfP06804 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TnfP06804 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TnfP06804 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TnfP06804 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TnfP06804 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnfP06804 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnfP06804 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnfP06804 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnfP06804 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnfP06804 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnfP06804 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TnfP06804 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnfP06804 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnfP06804 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnfP06804 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnfP06804 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TnfP06804 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnfP06804 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnfP06804 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnfP06804 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnfP06804 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnfP06804 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnfP06804 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnfP06804 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TnfP06804 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TnfP06804 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TnfP06804 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnfP06804 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TnfP06804 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnfP06804 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnfP06804 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnfP06804 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnfP06804 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnfP06804 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnfP06804 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnfP06804 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnfP06804 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnfP06804 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnfP06804 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TnfP06804 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnfP06804 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnfP06804 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnfP06804 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnfP06804 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnfP06804 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnfP06804 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnfP06804 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnfP06804 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnfP06804 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnfP06804 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnfP06804 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnfP06804 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnfP06804 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TnfP06804 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnfP06804 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnfP06804 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnfP06804 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnfP06804 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnfP06804 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnfP06804 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnfP06804 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TnfP06804 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnfP06804 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnfP06804 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnfP06804 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnfP06804 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnfP06804 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnfP06804 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TnfP06804 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms