Protein–RNA interactions for Protein: P06339

H2-T23, H-2 class I histocompatibility antigen, D-37 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T23P06339 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-T23P06339 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms