Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06336 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06336 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06336 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06336 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06336 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06336 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06336 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06336 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06336 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06336 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06336 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06336 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06336 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06336 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06336 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06336 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06336 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06336 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06336 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06336 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06336 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06336 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06336 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06336 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06336 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06336 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06336 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06336 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06336 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06336 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06336 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06336 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06336 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06336 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06336 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06336 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06336 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06336 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06336 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06336 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06336 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06336 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06336 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06336 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06336 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06336 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06336 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06336 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06336 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06336 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06336 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06336 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06336 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06336 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P06336 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06336 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06336 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06336 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06336 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P06336 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06336 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06336 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06336 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06336 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06336 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06336 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06336 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06336 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P06336 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06336 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P06336 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06336 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06336 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06336 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06336 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06336 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06336 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06336 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P06336 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06336 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06336 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06336 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06336 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06336 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06336 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06336 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06336 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P06336 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06336 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06336 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06336 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06336 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06336 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06336 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06336 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06336 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06336 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06336 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06336 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms