Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06321 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06321 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P06321 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P06321 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06321 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06321 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06321 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06321 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06321 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06321 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06321 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06321 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06321 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06321 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06321 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06321 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06321 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06321 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06321 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06321 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06321 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06321 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06321 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06321 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06321 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06321 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06321 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06321 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06321 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06321 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06321 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06321 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06321 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06321 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06321 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06321 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06321 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06321 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06321 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06321 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06321 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06321 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06321 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06321 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06321 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06321 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06321 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06321 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06321 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06321 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06321 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P06321 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06321 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06321 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06321 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06321 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06321 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06321 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06321 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06321 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06321 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06321 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06321 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06321 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06321 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06321 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06321 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06321 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06321 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06321 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06321 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P06321 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06321 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06321 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06321 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06321 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06321 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06321 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06321 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06321 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06321 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06321 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P06321 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06321 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06321 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06321 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06321 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06321 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06321 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06321 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06321 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06321 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06321 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06321 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06321 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06321 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06321 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06321 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06321 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms