Protein–RNA interactions for Protein: P05977

Myl1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl1P05977 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myl1P05977 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myl1P05977 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myl1P05977 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myl1P05977 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Myl1P05977 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms