Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-K1P01901 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms