Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01735 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01735 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01735 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01735 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01735 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01735 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01735 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01735 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01735 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01735 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01735 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01735 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01735 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01735 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01735 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01735 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01735 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01735 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01735 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
P01735 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01735 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01735 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01735 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01735 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01735 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01735 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01735 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01735 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01735 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01735 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01735 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01735 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01735 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01735 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01735 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01735 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01735 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01735 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01735 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01735 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01735 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01735 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01735 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01735 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01735 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01735 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01735 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01735 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01735 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01735 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01735 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01735 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01735 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01735 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01735 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01735 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01735 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01735 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01735 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01735 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01735 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01735 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01735 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01735 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01735 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01735 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01735 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01735 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01735 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms