Protein–RNA interactions for Protein: P01646

Ig kappa chain V-V region HP 123E6, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01646 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01646 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01646 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01646 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01646 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01646 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01646 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01646 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01646 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01646 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01646 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01646 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01646 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01646 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01646 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01646 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01646 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01646 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01646 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01646 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01646 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01646 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01646 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01646 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01646 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01646 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01646 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01646 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01646 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01646 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01646 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01646 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01646 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01646 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01646 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01646 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01646 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01646 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01646 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01646 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01646 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P01646 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01646 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01646 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01646 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01646 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01646 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01646 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01646 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01646 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01646 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01646 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01646 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01646 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01646 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01646 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01646 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01646 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01646 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01646 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01646 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01646 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01646 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01646 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01646 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01646 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01646 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01646 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01646 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01646 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01646 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01646 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01646 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01646 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01646 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01646 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01646 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P01646 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01646 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01646 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01646 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01646 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01646 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01646 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01646 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01646 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01646 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01646 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01646 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01646 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01646 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01646 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01646 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01646 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
P01646 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01646 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01646 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
P01646 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01646 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01646 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms