Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Robo1O89026 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Robo1O89026 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Robo1O89026 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Robo1O89026 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Robo1O89026 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Robo1O89026 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Robo1O89026 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Robo1O89026 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Robo1O89026 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Robo1O89026 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Robo1O89026 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Robo1O89026 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Robo1O89026 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Robo1O89026 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Robo1O89026 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Robo1O89026 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Robo1O89026 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Robo1O89026 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Robo1O89026 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Robo1O89026 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Robo1O89026 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Robo1O89026 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Robo1O89026 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Robo1O89026 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Robo1O89026 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Robo1O89026 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Robo1O89026 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Robo1O89026 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Robo1O89026 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Robo1O89026 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Robo1O89026 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Robo1O89026 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms