Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BlmO88700 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
BlmO88700 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BlmO88700 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
BlmO88700 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BlmO88700 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BlmO88700 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BlmO88700 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BlmO88700 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BlmO88700 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BlmO88700 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BlmO88700 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BlmO88700 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BlmO88700 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BlmO88700 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BlmO88700 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BlmO88700 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BlmO88700 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BlmO88700 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BlmO88700 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BlmO88700 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BlmO88700 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BlmO88700 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BlmO88700 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BlmO88700 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BlmO88700 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BlmO88700 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BlmO88700 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BlmO88700 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BlmO88700 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BlmO88700 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BlmO88700 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BlmO88700 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BlmO88700 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BlmO88700 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BlmO88700 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BlmO88700 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BlmO88700 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BlmO88700 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BlmO88700 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BlmO88700 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BlmO88700 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BlmO88700 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BlmO88700 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BlmO88700 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BlmO88700 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BlmO88700 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BlmO88700 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BlmO88700 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BlmO88700 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BlmO88700 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BlmO88700 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BlmO88700 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BlmO88700 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BlmO88700 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BlmO88700 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BlmO88700 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BlmO88700 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BlmO88700 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BlmO88700 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BlmO88700 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BlmO88700 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BlmO88700 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BlmO88700 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BlmO88700 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BlmO88700 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BlmO88700 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BlmO88700 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BlmO88700 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BlmO88700 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BlmO88700 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BlmO88700 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BlmO88700 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BlmO88700 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BlmO88700 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BlmO88700 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BlmO88700 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BlmO88700 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BlmO88700 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BlmO88700 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BlmO88700 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BlmO88700 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BlmO88700 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BlmO88700 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BlmO88700 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BlmO88700 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BlmO88700 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BlmO88700 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BlmO88700 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BlmO88700 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BlmO88700 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BlmO88700 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BlmO88700 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BlmO88700 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BlmO88700 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BlmO88700 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BlmO88700 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BlmO88700 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BlmO88700 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BlmO88700 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms