Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dll3O88516 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dll3O88516 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dll3O88516 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dll3O88516 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dll3O88516 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dll3O88516 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dll3O88516 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dll3O88516 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dll3O88516 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dll3O88516 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms