Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkcO88445 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkcO88445 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkcO88445 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkcO88445 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkcO88445 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
AurkcO88445 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AurkcO88445 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AurkcO88445 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms