Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtogO55225 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtogO55225 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtogO55225 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtogO55225 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
OtogO55225 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtogO55225 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtogO55225 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
OtogO55225 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtogO55225 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtogO55225 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtogO55225 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtogO55225 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtogO55225 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtogO55225 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtogO55225 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtogO55225 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtogO55225 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtogO55225 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtogO55225 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtogO55225 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
OtogO55225 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtogO55225 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtogO55225 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
OtogO55225 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtogO55225 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtogO55225 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
OtogO55225 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtogO55225 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtogO55225 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtogO55225 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtogO55225 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
OtogO55225 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtogO55225 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtogO55225 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtogO55225 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtogO55225 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtogO55225 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtogO55225 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtogO55225 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtogO55225 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtogO55225 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtogO55225 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtogO55225 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtogO55225 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtogO55225 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtogO55225 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtogO55225 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtogO55225 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtogO55225 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtogO55225 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtogO55225 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtogO55225 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtogO55225 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
OtogO55225 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OtogO55225 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtogO55225 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtogO55225 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtogO55225 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtogO55225 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtogO55225 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtogO55225 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtogO55225 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtogO55225 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtogO55225 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtogO55225 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtogO55225 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtogO55225 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtogO55225 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
OtogO55225 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
OtogO55225 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtogO55225 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtogO55225 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
OtogO55225 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtogO55225 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtogO55225 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtogO55225 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OtogO55225 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtogO55225 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtogO55225 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtogO55225 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtogO55225 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtogO55225 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtogO55225 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtogO55225 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OtogO55225 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
OtogO55225 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
OtogO55225 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
OtogO55225 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
OtogO55225 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
OtogO55225 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
OtogO55225 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
OtogO55225 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
OtogO55225 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
OtogO55225 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
OtogO55225 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
OtogO55225 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtogO55225 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtogO55225 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtogO55225 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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