Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrxO55103 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrxO55103 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrxO55103 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrxO55103 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrxO55103 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrxO55103 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrxO55103 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrxO55103 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrxO55103 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrxO55103 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrxO55103 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrxO55103 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrxO55103 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrxO55103 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrxO55103 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PrxO55103 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrxO55103 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrxO55103 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrxO55103 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrxO55103 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrxO55103 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrxO55103 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrxO55103 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrxO55103 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrxO55103 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrxO55103 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrxO55103 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrxO55103 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrxO55103 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrxO55103 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrxO55103 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrxO55103 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrxO55103 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrxO55103 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrxO55103 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrxO55103 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PrxO55103 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PrxO55103 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PrxO55103 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PrxO55103 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PrxO55103 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PrxO55103 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrxO55103 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrxO55103 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrxO55103 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrxO55103 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrxO55103 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrxO55103 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrxO55103 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrxO55103 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrxO55103 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrxO55103 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrxO55103 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrxO55103 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrxO55103 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrxO55103 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrxO55103 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrxO55103 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrxO55103 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrxO55103 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrxO55103 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrxO55103 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrxO55103 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrxO55103 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrxO55103 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrxO55103 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PrxO55103 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrxO55103 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrxO55103 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrxO55103 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrxO55103 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PrxO55103 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PrxO55103 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrxO55103 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrxO55103 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrxO55103 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrxO55103 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PrxO55103 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrxO55103 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrxO55103 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrxO55103 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrxO55103 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrxO55103 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrxO55103 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrxO55103 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrxO55103 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrxO55103 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrxO55103 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrxO55103 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrxO55103 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrxO55103 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrxO55103 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PrxO55103 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrxO55103 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PrxO55103 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrxO55103 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrxO55103 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrxO55103 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrxO55103 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms