Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Copb2O55029 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copb2O55029 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copb2O55029 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Copb2O55029 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copb2O55029 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copb2O55029 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copb2O55029 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Copb2O55029 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Copb2O55029 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copb2O55029 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copb2O55029 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copb2O55029 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Copb2O55029 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copb2O55029 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copb2O55029 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms