Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DffaO54786 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DffaO54786 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DffaO54786 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DffaO54786 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DffaO54786 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DffaO54786 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DffaO54786 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DffaO54786 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DffaO54786 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DffaO54786 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DffaO54786 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DffaO54786 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DffaO54786 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DffaO54786 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
DffaO54786 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DffaO54786 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DffaO54786 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DffaO54786 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DffaO54786 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DffaO54786 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DffaO54786 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DffaO54786 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DffaO54786 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DffaO54786 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DffaO54786 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DffaO54786 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DffaO54786 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DffaO54786 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DffaO54786 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DffaO54786 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DffaO54786 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DffaO54786 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DffaO54786 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DffaO54786 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DffaO54786 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DffaO54786 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DffaO54786 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DffaO54786 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DffaO54786 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
DffaO54786 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DffaO54786 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DffaO54786 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DffaO54786 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DffaO54786 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DffaO54786 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DffaO54786 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DffaO54786 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DffaO54786 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DffaO54786 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DffaO54786 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DffaO54786 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DffaO54786 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DffaO54786 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DffaO54786 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DffaO54786 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DffaO54786 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DffaO54786 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DffaO54786 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DffaO54786 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DffaO54786 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DffaO54786 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DffaO54786 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DffaO54786 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DffaO54786 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DffaO54786 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DffaO54786 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DffaO54786 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DffaO54786 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DffaO54786 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DffaO54786 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DffaO54786 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DffaO54786 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DffaO54786 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DffaO54786 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DffaO54786 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DffaO54786 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DffaO54786 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DffaO54786 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DffaO54786 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DffaO54786 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DffaO54786 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DffaO54786 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DffaO54786 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DffaO54786 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DffaO54786 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DffaO54786 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DffaO54786 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DffaO54786 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DffaO54786 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DffaO54786 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DffaO54786 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DffaO54786 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DffaO54786 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DffaO54786 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DffaO54786 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DffaO54786 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DffaO54786 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DffaO54786 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DffaO54786 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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