Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk3O35492 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk3O35492 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk3O35492 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk3O35492 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk3O35492 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk3O35492 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clk3O35492 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clk3O35492 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clk3O35492 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clk3O35492 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clk3O35492 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clk3O35492 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clk3O35492 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clk3O35492 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clk3O35492 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clk3O35492 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms