Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc27a2O35488 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms