Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema6aO35464 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema6aO35464 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms