Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Atf6bO35451 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Atf6bO35451 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atf6bO35451 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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