Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Abcc1O35379 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms