Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Sh2d1bO35324 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Sh2d1bO35324 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Sh2d1bO35324 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sh2d1bO35324 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Sh2d1bO35324 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Sh2d1bO35324 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Sh2d1bO35324 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Sh2d1bO35324 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sh2d1bO35324 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms