Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ncoa3O09000 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ncoa3O09000 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Ncoa3O09000 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncoa3O09000 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncoa3O09000 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncoa3O09000 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncoa3O09000 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncoa3O09000 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncoa3O09000 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncoa3O09000 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncoa3O09000 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncoa3O09000 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncoa3O09000 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncoa3O09000 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncoa3O09000 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncoa3O09000 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncoa3O09000 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncoa3O09000 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncoa3O09000 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncoa3O09000 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncoa3O09000 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncoa3O09000 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncoa3O09000 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms