Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Eftud2O08810 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms