Protein–RNA interactions for Protein: O08688

Capn5, Calpain-5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn5O08688 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn5O08688 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn5O08688 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn5O08688 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn5O08688 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn5O08688 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn5O08688 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn5O08688 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn5O08688 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms