Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6871L7N248 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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