Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2056J3QQ02 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms