Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20918J3QN17 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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