Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3415J3QMS8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
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