Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21411J3KMS0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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