Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm29394H3BIW7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm29394H3BIW7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms