Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tubgcp6G5E8P0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms