Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trip12G5E870 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trip12G5E870 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trip12G5E870 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trip12G5E870 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trip12G5E870 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trip12G5E870 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms