Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Pcf11G3X9Z4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms