Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nccrp1G3X9C2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms