Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2610008E11RikG3X964 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2610008E11RikG3X964 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms