Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn34aG3UW52 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms