Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Farp1F8VPU2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms