Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc37F8VPK0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc37F8VPK0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc37F8VPK0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc37F8VPK0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc37F8VPK0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc37F8VPK0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc37F8VPK0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc37F8VPK0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc37F8VPK0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc37F8VPK0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc37F8VPK0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc37F8VPK0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc37F8VPK0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc37F8VPK0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC24.76■■□□□ 1.56
Ttc37F8VPK0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc37F8VPK0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc37F8VPK0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc37F8VPK0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc37F8VPK0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc37F8VPK0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc37F8VPK0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc37F8VPK0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc37F8VPK0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc37F8VPK0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc37F8VPK0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc37F8VPK0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc37F8VPK0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc37F8VPK0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc37F8VPK0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc37F8VPK0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc37F8VPK0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc37F8VPK0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc37F8VPK0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc37F8VPK0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc37F8VPK0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc37F8VPK0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc37F8VPK0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms