Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Gm10378F6XQQ1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Gm10378F6XQQ1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Gm10378F6XQQ1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm10378F6XQQ1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
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Gm10378F6XQQ1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Gm10378F6XQQ1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Gm10378F6XQQ1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Gm10378F6XQQ1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Gm10378F6XQQ1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Gm10378F6XQQ1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Gm10378F6XQQ1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Gm10378F6XQQ1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm10378F6XQQ1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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