Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5861F6VCN9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5861F6VCN9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms