Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga10E9Q6R1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga10E9Q6R1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms