Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Simc1E9Q6E9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Simc1E9Q6E9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms