Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Srsf11E9Q6E5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srsf11E9Q6E5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms