Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtproE9Q612 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtproE9Q612 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms