Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r238E9Q373 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms