Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tarbp1E9Q368 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp1E9Q368 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms