Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20425E9Q035 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20425E9Q035 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms